Ketika sistem CNC diaktifkan, pemotongan yang diinginkan diprogram ke dalam perangkat lunak dan ditentukan ke alat dan mesin yang sesuai, yang melaksanakan tugas dimensi seperti yang ditentukan, seperti robot.

Dalam pemrograman CNC, pembuat kode dalam sistem numerik sering kali menganggap mekanismenya sempurna, meskipun ada kemungkinan kesalahan, yang lebih besar setiap kali mesin CNC diarahkan untuk memotong lebih dari satu arah secara bersamaan.Penempatan suatu alat dalam sistem kendali numerik diuraikan melalui serangkaian masukan yang dikenal dengan bagian program.

Dengan mesin kendali numerik, program dimasukkan melalui kartu punch.Sebaliknya, program untuk mesin CNC diumpankan ke komputer melalui keyboard kecil.Pemrograman CNC disimpan dalam memori komputer.Kode itu sendiri ditulis dan diedit oleh pemrogram.Oleh karena itu, sistem CNC menawarkan kapasitas komputasi yang jauh lebih besar.Yang terbaik dari semuanya, sistem CNC sama sekali tidak statis karena perintah baru dapat ditambahkan ke program yang sudah ada melalui kode yang direvisi.